Con el objetivo de fortalecer, acompañar y facilitar el quehacer educativo, además de generar vínculos entre ambas unidades educativas, la Oficina de Administración Central de la Fundación, tiene la misión de llevar a cabo procesos administrativos, de gestión, financieros, curriculares y pastorales, en base al Plan Pastoral de la FESPA y a los lineamientos que entrega el Ministerio de Educación. Actualmente en esta oficina trabajan 11 funcionarios animados por su compromiso de servicio y corresponsabilidad en los procesos que se viven en la Escuela San José Obrero y Liceo Técnico Profesional Juan Pablo II.